10月3日，据国外媒体报道，许多升级到苹果最新移动操作系统iOS9的用户抱怨称，他们的iPhone6s存在随机和意外断电问题。到目前为止，已经有多人在Reddit iPhone论坛、苹果支持论坛以及MacRumors博客中抱怨同样的问题。
这些苹果用户宣称，即使在充电和无人使用的情况下，他们的iPhone也会断电。有些用户称，iPhone关闭时，他们觉得主按钮有些热。大多数抱怨者使用的都是苹果于9月25日发布的iPhone6s或iPhone6s Plus，只有一人称iPhone5s也存在类似问题。还有人称，他们已经将操作系统升级至iOS9.0.2版本，现在正等着看是否会出现同样问题。
苹果目前还未就此发表置评。但无论新产品在正式发布前经过多少次测试，当数以百万计的用户购买和使用它们时，总会出现各种各样的随机性问题。到目前为止，苹果已经发布了两款针对iOS9的漏洞修复更新。iOS9.0.1主要修复系统卡顿问题，iOS9.0.2则修复锁屏安全问题。但是iOS系统中可能依然潜伏有各种漏洞。
更重要的是，苹果避免了去年发布iOS8时出现的大麻烦。当时进行最初漏洞修复时却出现新的漏洞，导致iOS 8获得不稳定的名声，许多人为此拒绝升级。
许多在论坛上发言的用户称，他们曾执行“硬启动”功能重启手机，即长按主按钮，然后再按睡眠/唤醒按键，直至手机重新启动。在这些用户的帖文中，没有明确描述断电问题是否与手机硬件、软件或两者有关。有些人推测这个问题可能与iPhone 6s使用的A9处理器有关。